Éric Legrand a un secret : dans les murs de sa maison vivent de minuscules créatures appelées les Minipouss. Ils sont de petits êtres à moitié hommes, vivant dans des cités de poupées bien terrées au fond des murs et des souterrains. Mais un scientifique et son assistant semblent déterminés à prouver l'existence de ces créatures et talonnent le jeune garçon qui doit redoubler de prudence et d'imagination pour protéger l'identité de ses petits amis.