Suite à des expériences génétiques, le jeune Makoto se retrouve doté de super-pouvoirs. Malgré le choc d'avoir été un cobaye aux mains de malfaiteurs, ces nouvelles aptitudes vont amener lui, et d'autres jeunes dans la même situation, à devenir les apprentis des Avengers respectivement composés de Thor, la Guêpe, Iron Man, Hulk et Captain America. Appelés à devenir les héros de demain, ces disciples vont devoir s'entraîner corps et âme pour défaire les vilains qui peuplent leur monde...