Dans un futur proche, une brusque montée des océans a causé l’immersion de la majorité de la civilisation. Quelques années plus tard, Ikaruga Natsuki, après avoir perdu sa mère et sa jambe dans un accident, décide de rentrer dans sa campagne à moitié submergé. Il ne lui reste désormais plus que le vieux sous-marin que lui a légué sa grand-mère, une célèbre océanographe, ainsi que sa montagne de dettes!
Catherine, une recouvreuse de dettes, lui propose un marché : ramener le trésor qui se trouverait dans le laboratoire immergé de sa grand-mère. Mais, bien loin des joyaux et autres richesses attendus, ils ne trouvent qu’une étrange jeune fille endormie au fond de l’océan. Pourrait-elle être le soutien dont il a besoin?